TIORREDOXINAS DE Eucalyptus grandis, DIVERSIDADE E EXPRESSÃO GÊNICA
Palavras-chave:
Tiorredoxinas, Genômica comparativa, RNA-seqResumo
Genomas de árvores tem sido sequenciados nos últimos anos e constituem uma fonte de informação de base para o estudo de famílias multigências em genômica comparativa. Neste trabalho, o interesse se concentra nos genes que codificam Tiorredoxinas (Trxs) em Eucalyptus grandis, enzimas oxidoredutases envolvidas em significativos processos bioquímicos, sobretudo na manutenção da homeostase celular. Aqui se considera a diversidade, estrutura e expressão desses genes no eucalipto. Para tanto, ferramentas de bioinformática foram empregadas para identificar sequências codantes e validar dados. Programas específicos foram empregados para caracterizar a estrutura e expressão dos genes. Ensaios de RT-PCR foram realizados para 4 genes de tiorredoxinas citoplasmáticas a partir de tecidos de folha, floema, xilema e meristema apical para confirmar a expressão observada in silico. Foram identificadas 22 Trxs com sítio ativo característico confirmando a existência de todos os representantes dos três principais grupos já definidos em plantas, plastidiais (m, f, x, y, z) citoplasmáticas (h), e mitocondriais (o) no genoma do eucalipto. Observaram-se, no entanto, diferenças quanto ao número de genes por grupos em comparação com outros genomas de árvores. A expressão desses genes de tiorredoxina mostrou-se, para alguns genes homólogos, divergente do que fora observado em Arabidopis thaliana sugerindo uma especificidade de função em eucalipto a exemplo do gene Eucgr.F01604 que codifica uma Trx citoplasmática h1 e que apresenta forte expressão em tecidos condutores.
Palavras-Chave: Tiorredoxinas; Genômica comparativa; RNA-seq
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