TIORREDOXINAS DE Eucalyptus grandis, DIVERSIDADE E EXPRESSÃO GÊNICA

Autores

  • Vitória Régia Alves Cavalcante Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de Pós-Graduação em Ciências Florestais,Jundiaí, RN - Brasil
  • Fabiana Silva de Araújo Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de Pós-Graduação em Ciências Florestais,Jundiaí, RN - Brasil
  • Diego Gomes Teixeira Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de Pós-Graduação em Bioinformática,Natal, RN - Brasil
  • Paulo Marinho Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Departamento de Biologia Celular e Genética,Natal, RN - Brasil

Palavras-chave:

Tiorredoxinas, Genômica comparativa, RNA-seq

Resumo

Genomas de árvores tem sido sequenciados nos últimos anos e constituem uma fonte de informação de base para o estudo de famílias multigências em genômica comparativa. Neste trabalho, o interesse se concentra nos genes que codificam Tiorredoxinas (Trxs) em Eucalyptus grandis, enzimas oxidoredutases envolvidas em significativos processos bioquímicos, sobretudo na manutenção da homeostase celular. Aqui se considera a diversidade, estrutura e expressão desses genes no eucalipto. Para tanto, ferramentas de bioinformática foram empregadas para identificar sequências codantes e validar dados. Programas específicos foram empregados para caracterizar a estrutura e expressão dos genes. Ensaios de RT-PCR foram realizados para 4 genes de tiorredoxinas citoplasmáticas a partir de tecidos de folha, floema, xilema e meristema apical para confirmar a expressão observada in silico. Foram identificadas 22 Trxs com sítio ativo característico confirmando a existência de todos os representantes dos três principais grupos já definidos em plantas, plastidiais (m, f, x, y, z) citoplasmáticas (h), e mitocondriais (o) no genoma do eucalipto. Observaram-se, no entanto, diferenças quanto ao número de genes por grupos em comparação com outros genomas de árvores. A expressão desses genes de tiorredoxina mostrou-se, para alguns genes homólogos, divergente do que fora observado em Arabidopis thaliana sugerindo uma especificidade de função em eucalipto a exemplo do gene Eucgr.F01604 que codifica uma Trx citoplasmática h1 e que apresenta forte expressão em tecidos condutores.

Palavras-Chave: Tiorredoxinas; Genômica comparativa; RNA-seq

Downloads

Publicado

2020-04-22

Como Citar

Cavalcante, V. R. A., de Araújo, F. S., Teixeira, D. G., & Marinho, P. (2020). TIORREDOXINAS DE Eucalyptus grandis, DIVERSIDADE E EXPRESSÃO GÊNICA. Revista Árvore, 43(06), https://doi.org/10.1590/1806–90882019000600002. Recuperado de https://revistaarvore.ufv.br/rarv/article/view/218633